Gua Karst

Taman Nasional Kutai juga memiliki potensi kawasan bukit kapur/gamping (karst) yang belum banyak diketahui oleh masyarakat luas. Ciri-ciri kawasan karts diperlihatkan pada kawasan batu gamping di daerah Sangatta yang terserak di kawasan selatan Gunung Murung, kemudian ke kawasan Taman Nasional Kutai. Di kawasan Taman Nasional Kutai, pada beberapa kawasan jelas menunjukkan sisa batuan karst, yaitu mempunyai sungai bawah tanah, bahkan pada beberapa gua terdapat anak sungai yang menghilang masuk ke batu gamping.

Kawasan karst Taman Nasional Kutai termasuk dalam karst Kendolo. Karst Kendolo mempunyai bentangan utara-selatan, namun arah guanya tidak serta merta memanjang utaraselatan. Puncak-puncak bukit gamping yang merupakan gugusan karst Kendolo tersebut relatif berbukit landai dan tidak membentuk tebing-tebing karst yang curam. Ekosistem gua-gua di Kendolo banyak dibantu oleh masih baiknya hutan-hutan di wilayah perikarsnya. Ponor-ponor (bentukan di karst tempat air masuk ke dalam bawah permukaan) di puncak bukit karst berkumpul di satu tempat dan kemudian biasanya pada bagian bawahnya muncul gua-gua dari bukit karst. Luas dan sebaran batu gamping di Kendolo tidak melebar, namun rapi memanjang dari utara-selatan.

Bukit karst Kendolo tidak mempunyai gua-gua yang luas. Gua yang besar adalah Gua Lubang Angin dan Gua Sampekmarta. Gua-gua lain tampaknya sulit dijelajahi karena muaranya sempit atau lorongnya sempit dan curam. Gua-gua tersebut relatif basah dan beberapa merupakan gua ponor atau tempat air masuk, sehingga lorong di dalam guanya berlumpur dan berair.

Beberapa gua yang telah diidentifikasi di Taman Nasional Kutai di antaranya adalah: gua Sampek Marta, gua Lubang Angin, gua Tungap, gua Tengah, gua Kelelawar, gua Buaya, gua Sarang Hitam, gua Sangkima, dan gua Busur. Untuk kegiatan wisata penelusuran gua, saat ini hanya gua Lubang Angin dan gua Sampekmarta yang boleh dikunjungi oleh wisatawan. Sedangkan gua-gua yang lain hanya diizinkan untuk kegiatan penelitian.

Khusus untuk wisatawan yang ingin berkunjung ke gua Lubang Angin maupun gua
Sampekmarta, diwajibkan untuk melapor terlebih dahulu ke kantor Balai Taman Nasional Kutai di Bontang. Wisatawan yang masuk ke kedua gua tersebut jumlahnya dibatasi dan wajib didampingi oleh petugas Balai Taman Nasional Kutai.